Sunt organizate pe langa fiecare instanta militara si indeplinesc atributiile Ministerului Public. Potrivit legii nr. 54 din 9 iulie 1993, parchetele militare functioneaza in municipiile Bacau, Brasov, Bucuresti, Cluj-Napoca, Constanta, Craiova, Iasi, Oradea, Ploiesti, Targu-Mures si Timisoara. Ele sunt conduse de catre primi-procurori militari ajutati de primi-procurori militari adjuncti.